A Educação Integral compreende o desenvolvimento do educando em sua multidimensionalidade, ou seja, em suas dimensões cognitiva, física, social, emocional e cultural. Para esse desafio, a Rede oferta a carga horária estendida de 7 ou 8 horas diárias e busca a construção de uma matriz curricular diferenciada para os estudantes da Educação Infantil ao Ensino Fundamental – Anos Iniciais e Anos Finais. Por funcionarem em tempo estendido, as Unidades Escolares de Educação Integral podem apresentar matrizes curriculares vocacionadas, tendo componentes específicos na parte diversificada, como são os casos das Escolas do Programa Bilíngue (Inglês, Espanhol, Francês, Alemão e Mandarim) e dos Ginásios Educacionais Olímpicos (GEOs), Ginásio Educacional de Arte (GEA), Ginásio Educacional de Música (GEM), Ginásio Experimental de Novas Tecnologias Educacionais (GENTE), Ginásios Educacionais Tecnológicos (GETs) e da Escola Cívico-Militar (ECIM).
Elaborar e gerenciar o modelo pedagógico e de gestão das escolas do Programa de Educação Integral e de Educação Integral vocacionadas e acompanhar a sua implementação são os principais objetivos da frente de atuação. Liderada pela professora Elizabeth Gil, a Gerência de Educação Integral (GEIN) faz parte da Coordenadoria de Educação Integral (CEIN) liderada pela professora Josecy Brilhantino e fomenta práticas, abordagens e metodologias que qualificam o horário ampliado dessas Unidades Escolares, favorecendo o desenvolvimento integral dos estudantes cariocas.